34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_7544 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_7544  predicted protein  100 
 
 		 135 aa  276  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.13 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.71 
 
 		 273 aa  57  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.88 
 
 		 270 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.45 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  30.3 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.27 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.43 
 
 		 280 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.45 
 
 		 394 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.45 
 
 		 394 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 		 260 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  27.27 
 
 		 289 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.58 
 
 		 276 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.63 
 
 		 275 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.58 
 
 		 278 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.83 
 
 		 257 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.39 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.64 
 
 		 282 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  40 
 
 		 271 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  40 
 
 		 300 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  32.71 
 
 		 276 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  32 
 
 		 270 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  39.29 
 
 		 261 aa  43.5  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  31 
 
 		 276 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_85999  predicted protein  27.2 
 
 		 407 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.82 
 
 		 305 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3366  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.37 
 
 		 288 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.33 
 
 		 260 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  40 
 
 		 281 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0615  hypothetical protein  33 
 
 		 329 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.25162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.67 
 
 		 277 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.89 
 
 		 293 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.87 
 
 		 269 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.24 
 
 		 266 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>