45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3257 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 305 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  69.83 
 
 		 309 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  69.73 
 
 		 309 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.68 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.07 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.38 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.33 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.3 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.49 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.54 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  25.86 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.81 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.4 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.36 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.3 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.62 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.6 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.62 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.62 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.85 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  22.12 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.75 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.67 
 
 		 394 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.67 
 
 		 394 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.24 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.38 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.6 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.9 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.83 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.33 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.26 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  22.71 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 		 282 aa  45.8  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  25.63 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  23.29 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.18 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.97 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  21.62 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  22.09 
 
 		 258 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  27.22 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.288196 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04647  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01850)  23.79 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.08 
 
 		 253 aa  42.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_7544  predicted protein  27.82 
 
 		 135 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>