60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1483 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.66 
 
 		 279 aa  218  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.31 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  45.79 
 
 		 283 aa  208  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.98 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.42 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.87 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.91 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.91 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.38 
 
 		 282 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  44.28 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.91 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  41.98 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.21 
 
 		 264 aa  188  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  40.33 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3366  phytanoyl-CoA dioxygenase  38.37 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.5 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4327  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.33 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.0438049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.33 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4363  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.56 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5816  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.68 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5044  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.68 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5715  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.18 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6836  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.94 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0909403  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2735  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.3 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5713  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.81 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.47 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.08 
 
 		 394 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.47 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43737  phytanoyl-coa dioxygenase  25.57 
 
 		 409 aa  65.9  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.36 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.41 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  26.39 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.51 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.02 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.09 
 
 		 251 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.41 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_85999  predicted protein  29.41 
 
 		 407 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.7 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.42 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.3 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.65 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.92 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.17 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48320  predicted protein  26.71 
 
 		 410 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.82 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  25 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.41 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  29.2 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  29.2 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.82 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.17 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  29.2 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.53 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  29.2 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  29.2 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.07 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.01 
 
 		 257 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>