120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2990 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 257 aa  536  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  98.05 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  94.16 
 
 		 257 aa  507  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  93.39 
 
 		 281 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  93.77 
 
 		 257 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  92.61 
 
 		 257 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  93.77 
 
 		 257 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  80.39 
 
 		 306 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  80.39 
 
 		 306 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  80.78 
 
 		 306 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  80.39 
 
 		 256 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  80.39 
 
 		 306 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  80.39 
 
 		 297 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  79.84 
 
 		 253 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  79.84 
 
 		 253 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  71.49 
 
 		 253 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  72.29 
 
 		 253 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  69.17 
 
 		 253 aa  370  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  50 
 
 		 263 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  50 
 
 		 263 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  49.6 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  46.3 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  46.09 
 
 		 270 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  45.68 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  45.83 
 
 		 268 aa  228  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.71 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.81 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  26.86 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.69 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  26.21 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.52 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.49 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.88 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.5 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.88 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.88 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.88 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.05 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  26.29 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.5 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.63 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.29 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  28 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.33 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.54 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.18 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.91 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  26.17 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.48 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.65 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  22.22 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  24.29 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.05 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.95 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  23.48 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.14 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.31 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.77 
 
 		 320 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.11 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.38 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  28 
 
 		 302 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.67 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 		 299 aa  52  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  23.39 
 
 		 314 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  23.48 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  26.03 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.14 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  27.36 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  23.97 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  25.81 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.12 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.14 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.61 
 
 		 279 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  23.48 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.77 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 		 230 aa  48.9  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  22.49 
 
 		 302 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.19 
 
 		 291 aa  48.9  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 		 284 aa  48.5  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48560  hypothetical protein  26.79 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.947349  normal  0.0199481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.54 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.35 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.6 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  24.79 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  23.4 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.98 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.94 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.63 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  25.43 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.36 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.72 
 
 		 275 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>