17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4291 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4291  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 302 aa  605  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.768116  hitchhiker  0.00438427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0319  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.92 
 
 		 328 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0327  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.89 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6819  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.5 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0935  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.96 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2678  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.53 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.61 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59203  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00150  Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH)  27.95 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3519  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.13 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  26.29 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3845  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.74 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01262  conserved hypothetical protein  22.18 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0169666  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1160  putative dehydrogenase  25 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.63 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 		 278 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.27 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.82 
 
 		 394 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>