13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3845 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3845  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 267 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.14 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0327  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.33 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  31.45 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4291  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.74 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.768116  hitchhiker  0.00438427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.36 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.25 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  24.75 
 
 		 276 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.76 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.17 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.9 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.17 
 
 		 265 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>