28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2678 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2678  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 307 aa  627  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  86.32 
 
 		 307 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59203  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3519  Phytanoyl-CoA dioxygenase  45.15 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00150  Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH)  43.14 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01262  conserved hypothetical protein  38.1 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0169666  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0935  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.83 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1160  putative dehydrogenase  32.45 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4291  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.53 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.768116  hitchhiker  0.00438427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.63 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6819  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.4 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  22.14 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.57 
 
 		 278 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0319  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.95 
 
 		 328 aa  52.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.48 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  22.4 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0327  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.97 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.7 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3366  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.87 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.83 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.75 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.21 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.78 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.98 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.92 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.68 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.01 
 
 		 258 aa  42.7  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>