34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3838 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3748  hypothetical protein  26.59 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.582113  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3661  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.43 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.305414 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4738  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.43 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0935  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.02 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.95 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.5 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.09 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3845  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.14 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.85 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.26 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3519  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.73 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.46 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.95 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0319  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.54 
 
 		 328 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  33.96 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  22.82 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59203  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  20.88 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.63 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00150  Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH)  27.12 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.23 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.15 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.03 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2678  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.78 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  34 
 
 		 329 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2447  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  21.79 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6819  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.67 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.81 
 
 		 273 aa  42  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.89 
 
 		 257 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>