24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2355 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
307 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59203  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2678  Phytanoyl-CoA dioxygenase  86.32 
 
 
307 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3519  Phytanoyl-CoA dioxygenase  44.15 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00150  Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH)  43.67 
 
 
283 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01262  conserved hypothetical protein  35.76 
 
 
324 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0169666  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0935  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 
313 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130252  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1160  putative dehydrogenase  32.28 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4291  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.61 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.768116  hitchhiker  0.00438427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.63 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.72 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.57 
 
 
271 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0319  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
328 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533588  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  20.62 
 
 
268 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.29 
 
 
275 aa  49.3  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.63 
 
 
277 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6819  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.89 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  22.75 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.73 
 
 
253 aa  46.2  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.82 
 
 
284 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.1 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  22.86 
 
 
258 aa  42.7  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.52 
 
 
278 aa  42.7  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>