44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_11261 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  49.37 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.91 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.84 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45928  predicted protein  31.05 
 
 		 359 aa  105  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.48 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.85 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.05 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  25.84 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.58 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.7 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.64 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.43 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.33 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.49 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.15 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.34 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  25.4 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.4 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  23.47 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.02 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.58 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.46 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  27.35 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.73 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  24.9 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.93 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.61 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.67 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.97 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.35 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.17 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.04 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.87 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.29 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.14 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.71 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.24 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.29 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>