40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_12551 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  49.37 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  40.59 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.63 
 
 		 251 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45928  predicted protein  31.89 
 
 		 359 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178958  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.4 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  27.57 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.91 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.35 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.06 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.33 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.23 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.79 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.84 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.48 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.91 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.52 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.22 
 
 		 285 aa  52.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.16 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.09 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.4 
 
 		 394 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.4 
 
 		 394 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.35 
 
 		 372 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.22 
 
 		 296 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.41 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.94 
 
 		 277 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.22 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.22 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.87 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.68 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.65 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.66 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.45 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.16 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.82 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  28.8 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  23.81 
 
 		 329 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.54 
 
 		 275 aa  42  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>