125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0080 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 253 aa  526  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  84.58 
 
 		 253 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  83.79 
 
 		 253 aa  454  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  77.14 
 
 		 297 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  77.14 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  77.14 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  77.14 
 
 		 256 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  77.14 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  76.73 
 
 		 306 aa  390  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  77.14 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  75.92 
 
 		 306 aa  387  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  71.08 
 
 		 281 aa  374  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  70.36 
 
 		 257 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  69.96 
 
 		 257 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  69.57 
 
 		 257 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  69.57 
 
 		 257 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  69.96 
 
 		 257 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  69.17 
 
 		 257 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  50.21 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  50.21 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  49.38 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  47.54 
 
 		 273 aa  241  7e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  44.94 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  49.57 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.5 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  28.33 
 
 		 300 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.21 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.32 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.39 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  26.67 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.49 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.45 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.36 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.97 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.1 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.03 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.26 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.61 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.26 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.61 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.61 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.61 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.93 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.11 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.78 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.59 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.03 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  24.06 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.29 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  21.86 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  24.14 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  25.09 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  24.61 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  23.17 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.31 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  26.13 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.08 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.41 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.58 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  22.83 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  26.06 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.89 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.83 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.59 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.87 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.25 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.25 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.21 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.43 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.08 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.5 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  29.91 
 
 		 266 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.78 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  26.56 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.53 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.47 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  29.06 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3519  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.87 
 
 		 295 aa  52.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  27.12 
 
 		 289 aa  52  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  23.2 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.31 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.5 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.54 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.69 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.03 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  29.92 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.28 
 
 		 292 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.07 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.12 
 
 		 301 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.88 
 
 		 265 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.52 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.45 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.75 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.68 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.44 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  25.95 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  22.08 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>