61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3752 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 259 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  39.36 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.98 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.97 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  36.67 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.96 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.47 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  30.46 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.75 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.84 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.58 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  29.55 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.98 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  25.77 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  27 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  27.14 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.14 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.65 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  34.65 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  28.47 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  34.65 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  34.65 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  34.65 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  34.65 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  34.65 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.87 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.95 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.95 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.95 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.25 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.95 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  28.8 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.5 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  25.23 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.33 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.95 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 		 292 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.99 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6528  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.83 
 
 		 283 aa  49.3  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  32.65 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.85 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.85 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  26.54 
 
 		 416 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.25 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  23.32 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.98 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.93 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  31 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.89 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2233  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.15 
 
 		 314 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2171  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.67 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3845  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.76 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  31.03 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00020  expressed protein  24.36 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.88 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  29.41 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.23 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.326612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>