74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1560 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 302 aa  630  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  57.14 
 
 		 304 aa  359  3e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  54.86 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  54.95 
 
 		 332 aa  348  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  54.79 
 
 		 306 aa  330  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  51.38 
 
 		 300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  48.44 
 
 		 306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  50.68 
 
 		 296 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  48.78 
 
 		 302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  46.69 
 
 		 302 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  51.22 
 
 		 306 aa  298  7e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  49.3 
 
 		 314 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  48.07 
 
 		 315 aa  290  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  46.05 
 
 		 298 aa  285  9e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  45.73 
 
 		 302 aa  267  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  45.58 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  45.64 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  45.64 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  45.8 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  44.14 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  40.62 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.82 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  35.82 
 
 		 266 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.47 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.07 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  36 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.13 
 
 		 284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.43 
 
 		 253 aa  92.8  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 		 260 aa  89.4  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  29.2 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.09 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.59 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.59 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  27.71 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.22 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  25.59 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  22.78 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.22 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.31 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.81 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.89 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.31 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.58 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.96 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.77 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.93 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.47 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.12 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  20.95 
 
 		 253 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.83 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.56 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  23.23 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.52 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  23.23 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  23.23 
 
 		 256 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.22 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.56 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  23.11 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.11 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.04 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.11 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.95 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.23 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.91 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.78 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41990  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.7 
 
 		 248 aa  46.2  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.95 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  23 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  22.68 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.43 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3783  hypothetical protein  28.1 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.35 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>