85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0138 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  100 
 
 
302 aa  625  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  65.42 
 
 
296 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  60.68 
 
 
300 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  57.58 
 
 
298 aa  361  8e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  59.15 
 
 
315 aa  351  7e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  50.69 
 
 
304 aa  316  3e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  46.69 
 
 
302 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  48.31 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  51.76 
 
 
314 aa  301  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  50.68 
 
 
304 aa  300  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  52.07 
 
 
303 aa  297  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  49.15 
 
 
291 aa  296  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  49.67 
 
 
299 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  48.97 
 
 
306 aa  295  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  51.4 
 
 
306 aa  295  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  49.33 
 
 
299 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  49.33 
 
 
299 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  48.1 
 
 
332 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  45.1 
 
 
306 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  42.61 
 
 
302 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  45.24 
 
 
302 aa  248  8e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.82 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.13 
 
 
268 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  31.78 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.82 
 
 
293 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.83 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.81 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.67 
 
 
284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  26.97 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.08 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  25.33 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.54 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.07 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.87 
 
 
260 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.54 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.18 
 
 
258 aa  58.9  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.14 
 
 
253 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  26.74 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  24.77 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.27 
 
 
283 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.51 
 
 
282 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.57 
 
 
281 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.45 
 
 
279 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.19 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.11 
 
 
273 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.87 
 
 
259 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.8 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.28 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.28 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.12 
 
 
239 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.46 
 
 
257 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.89 
 
 
257 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.89 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.16 
 
 
293 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.89 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.49 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  27.91 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.91 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.91 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.16 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  27.91 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.02 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.45 
 
 
260 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.3 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  28.71 
 
 
263 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37164  predicted protein  26.63 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 
394 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.45 
 
 
306 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 
394 aa  45.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
296 aa  45.8  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.03 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  19.74 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.85 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.14 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  19.92 
 
 
251 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.94 
 
 
276 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41990  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
248 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  21.03 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.35 
 
 
306 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.25 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.56 
 
 
230 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.85 
 
 
274 aa  42.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.42 
 
 
271 aa  42.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.81 
 
 
309 aa  42.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>