79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1558 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
268 aa  551  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  81.72 
 
 
266 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  53.05 
 
 
293 aa  292  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  51.1 
 
 
301 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.98 
 
 
284 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.27 
 
 
274 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  38.82 
 
 
264 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.82 
 
 
302 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  33.21 
 
 
304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  35.04 
 
 
306 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  36.26 
 
 
302 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  35.43 
 
 
314 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  33.6 
 
 
306 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  36.47 
 
 
306 aa  155  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  35.5 
 
 
296 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  33.6 
 
 
300 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  34.13 
 
 
302 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  33.33 
 
 
315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  32.32 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  34.27 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  32.95 
 
 
299 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  32.82 
 
 
299 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  32.82 
 
 
299 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  31.75 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  30.2 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  31.66 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  33.49 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.97 
 
 
302 aa  128  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.26 
 
 
260 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.47 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.28 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  27.39 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.24 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.06 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.51 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.39 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  22.27 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.14 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.58 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.58 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.61 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  25.49 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.58 
 
 
293 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 
306 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  24.1 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.12 
 
 
306 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.74 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.17 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.74 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  23.74 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.92 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  23.74 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.54 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  23.74 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  23.74 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.62 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  24.88 
 
 
276 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3661  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.69 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.305414 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4738  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.69 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.58 
 
 
275 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.17 
 
 
265 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.35 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.52 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.36 
 
 
257 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.53 
 
 
257 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.99 
 
 
300 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  25.39 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.45 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.53 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0110  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.33 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.806567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.58 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.31 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  21.79 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  22.69 
 
 
298 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  22.39 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.13 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.21 
 
 
278 aa  42.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6528  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.14 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.34 
 
 
261 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>