49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2409 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  37.19 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.58 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  35.29 
 
 		 291 aa  62  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.61 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.86 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  24.54 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  30.82 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.6 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.13 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  43.06 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1417  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.93 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.04 
 
 		 288 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.22 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.14 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.326612 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  25.73 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.13 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.35 
 
 		 292 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.35 
 
 		 292 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.04 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.29 
 
 		 315 aa  48.5  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  32.43 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.67 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  31.53 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  28.66 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  24.84 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0573  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.31 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46716  predicted protein  31.53 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.99 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.45 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  30.97 
 
 		 304 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3596  hypothetical protein  30 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.08 
 
 		 291 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  23.6 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.57 
 
 		 293 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.45 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  33.66 
 
 		 416 aa  45.1  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.09 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  24.69 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.11 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  24.42 
 
 		 298 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.5 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  30.48 
 
 		 289 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.3 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  26.06 
 
 		 298 aa  42.4  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  29.49 
 
 		 295 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.26 
 
 		 260 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>