69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5814 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  100 
 
 
296 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  65.42 
 
 
302 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  66.1 
 
 
300 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  57.53 
 
 
298 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  55.94 
 
 
315 aa  335  7e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  54.14 
 
 
291 aa  321  8e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  53.24 
 
 
306 aa  319  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  52.58 
 
 
304 aa  317  2e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  53.47 
 
 
299 aa  311  9e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  50.68 
 
 
302 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  51.21 
 
 
304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  52.6 
 
 
299 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  52.6 
 
 
299 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  51.03 
 
 
303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  49.15 
 
 
311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  49.83 
 
 
306 aa  298  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  51.06 
 
 
314 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  48.98 
 
 
332 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  47.74 
 
 
306 aa  287  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  44.9 
 
 
302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  41.84 
 
 
302 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.5 
 
 
268 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.08 
 
 
274 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  34.24 
 
 
266 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.07 
 
 
284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.92 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.02 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.14 
 
 
264 aa  112  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  26.01 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.51 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  22.78 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.71 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.4 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.68 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.29 
 
 
320 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.68 
 
 
260 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.99 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.55 
 
 
257 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  22.96 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.82 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  24.16 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 
279 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.56 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.03 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  25.97 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.28 
 
 
273 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.98 
 
 
275 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.69 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.69 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  23.36 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.58 
 
 
253 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  20.08 
 
 
253 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.08 
 
 
260 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.15 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  23.97 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  22.95 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  22.95 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  22.95 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  21.32 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.63 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  23.02 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  27.38 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  19.28 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  27.13 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.97 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.97 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.99 
 
 
257 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.05 
 
 
300 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.58 
 
 
309 aa  42.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>