44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1305 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  28 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.51 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.06 
 
 		 282 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  26.88 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.65 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  26.51 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.19 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  23.51 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  23.95 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  32.74 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.36 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.6 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.55 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  25.3 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  25.99 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.59 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.65 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  33.57 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  27.89 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.41 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.41 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.16 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.46 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.15 
 
 		 298 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  25.29 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.71 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.74 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  29.81 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.33 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  25.2 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1417  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.1 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.19 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.326612 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.98 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.71 
 
 		 292 aa  48.9  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.95 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.99 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  25.32 
 
 		 311 aa  46.2  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0114  hypothetical protein  22.48 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  23.79 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.7 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0323  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.54 
 
 		 313 aa  42  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>