62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0003 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 274 aa  564  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.94 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  39.38 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  38.97 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  37.63 
 
 		 301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.22 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  35.29 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  34.43 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  33.46 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.07 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  33.82 
 
 		 302 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  31.2 
 
 		 315 aa  152  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.21 
 
 		 302 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  33.09 
 
 		 311 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  32.83 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  33.09 
 
 		 300 aa  148  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  31.2 
 
 		 299 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  31.2 
 
 		 299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  31.2 
 
 		 299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  33.09 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  32.72 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  32.77 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  33.08 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  29.17 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  31.18 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  28.36 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  28.99 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  31.18 
 
 		 306 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  25.59 
 
 		 296 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.72 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.16 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.1 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.31 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  20.56 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.7 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  20.33 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.28 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.59 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  21.24 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  19.49 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.5 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.12 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.27 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.67 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.88 
 
 		 273 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.19 
 
 		 279 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.37 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  21.89 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.83 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.73 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  20.39 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  25.82 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.85 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.84 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  22.04 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  21.23 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.36 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.09 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.24 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.25 
 
 		 275 aa  42  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>