28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5713 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5713  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 281 aa  587  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5044  phytanoyl-CoA dioxygenase  55.68 
 
 		 277 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5816  phytanoyl-CoA dioxygenase  55.68 
 
 		 277 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4363  phytanoyl-CoA dioxygenase  55.31 
 
 		 277 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6836  phytanoyl-CoA dioxygenase  53.85 
 
 		 277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0909403  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2735  phytanoyl-CoA dioxygenase  52.75 
 
 		 277 aa  299  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  41.22 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4327  Phytanoyl-CoA dioxygenase  41.22 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.0438049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5715  phytanoyl-CoA dioxygenase  40.85 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.9 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.93 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.94 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.53 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  26.81 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  24.15 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  23.77 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.18 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.07 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.82 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.46 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.05 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.46 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.46 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.55 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3366  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.12 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.55 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.98 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.43 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>