30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5044 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5816  phytanoyl-CoA dioxygenase  99.64 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5044  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 277 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4363  phytanoyl-CoA dioxygenase  98.92 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6836  phytanoyl-CoA dioxygenase  83.03 
 
 		 277 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0909403  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2735  phytanoyl-CoA dioxygenase  66.43 
 
 		 277 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5713  phytanoyl-CoA dioxygenase  55.68 
 
 		 281 aa  310  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5715  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.23 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.44 
 
 		 276 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4327  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.44 
 
 		 276 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.0438049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  32.68 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.45 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3366  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.46 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.41 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.89 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.47 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.47 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.47 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.04 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.04 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.61 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.49 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.82 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  26.64 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.07 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  25.51 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.78 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.2 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.55 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43737  phytanoyl-coa dioxygenase  22.02 
 
 		 409 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.31 
 
 		 254 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>