65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0133 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
264 aa  545  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  52.12 
 
 
266 aa  290  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.7 
 
 
279 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.64 
 
 
284 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.77 
 
 
282 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.4 
 
 
282 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.02 
 
 
282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.02 
 
 
282 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.02 
 
 
282 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.4 
 
 
283 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.82 
 
 
282 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  42.21 
 
 
287 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  40.94 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  40.16 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  39.55 
 
 
274 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.22 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3366  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.07 
 
 
288 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2735  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.2 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5715  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.21 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4327  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.63 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.0438049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.63 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4363  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.07 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5816  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.07 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5044  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.07 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.88 
 
 
394 aa  72.4  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5713  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.05 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6836  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.47 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0909403  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.05 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  24.64 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.47 
 
 
268 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.03 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.11 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.84 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.09 
 
 
300 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.46 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.56 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.56 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  27.15 
 
 
326 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.78 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.66 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.09 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.65 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.55 
 
 
230 aa  49.3  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43737  phytanoyl-coa dioxygenase  23.27 
 
 
409 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.45 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  26.7 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.05 
 
 
320 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.3 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  24.06 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.96 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0615  hypothetical protein  21.21 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.25162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  23.92 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.3 
 
 
254 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.06 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48320  predicted protein  25.45 
 
 
410 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.62 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  26.82 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  26.82 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.29 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.29 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.41 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>