30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43737 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43737  phytanoyl-coa dioxygenase  100 
 
 		 409 aa  856    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.18 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.18 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.18 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  25.57 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.96 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3366  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.92 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.87 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  23.16 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.83 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.19 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.45 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.21 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.09 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.71 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 284 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  21.82 
 
 		 266 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.74 
 
 		 274 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.71 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.58 
 
 		 270 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.54 
 
 		 293 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  18.66 
 
 		 273 aa  49.7  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.27 
 
 		 264 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6836  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.77 
 
 		 277 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0909403  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.42 
 
 		 269 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5715  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.17 
 
 		 300 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  22.15 
 
 		 300 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4363  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.38 
 
 		 277 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2735  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.22 
 
 		 277 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>