35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5715 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5715  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 276 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  83.33 
 
 		 276 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4327  Phytanoyl-CoA dioxygenase  83.33 
 
 		 276 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.0438049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5044  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.23 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5816  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.23 
 
 		 277 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4363  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.23 
 
 		 277 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6836  phytanoyl-CoA dioxygenase  44.03 
 
 		 277 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0909403  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2735  phytanoyl-CoA dioxygenase  40.29 
 
 		 277 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5713  phytanoyl-CoA dioxygenase  40.85 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  32.18 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 284 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.58 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.98 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.33 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.33 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.15 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.33 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.5 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.5 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.5 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.08 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  26.97 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  25.62 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3366  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.91 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.21 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.98 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.48 
 
 		 273 aa  52.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.45 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  21.99 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43737  phytanoyl-coa dioxygenase  23.53 
 
 		 409 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.42 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.13 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.21 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.91 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  35.09 
 
 		 190 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>