50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46163 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  100 
 
 
326 aa  681    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  37.33 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.44 
 
 
276 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.89 
 
 
268 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.78 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.57 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.41 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.82 
 
 
260 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.61 
 
 
259 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  28.5 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  26.8 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  29.63 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  29.63 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  27.78 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.75 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.75 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.75 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  28.65 
 
 
310 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.54 
 
 
275 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.15 
 
 
264 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.01 
 
 
230 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  29.48 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  30.77 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  30.77 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  30.77 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.17 
 
 
261 aa  50.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 
239 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.84 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.7 
 
 
320 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.39 
 
 
278 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 
274 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 
293 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  27.53 
 
 
304 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 
257 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  25.6 
 
 
319 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  25.6 
 
 
331 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  28.47 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.03 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.93 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.11 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  22.47 
 
 
263 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_002978  WD0615  hypothetical protein  29.22 
 
 
329 aa  43.9  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.25162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  30.07 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.84 
 
 
265 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.8 
 
 
258 aa  43.5  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48560  hypothetical protein  26.09 
 
 
292 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.947349  normal  0.0199481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  30.56 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.91 
 
 
285 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  29.17 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>