58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3440 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  100 
 
 
296 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  49.13 
 
 
301 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  49.13 
 
 
301 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  49.13 
 
 
301 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  49.13 
 
 
301 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  42.09 
 
 
332 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  41.16 
 
 
308 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  41.16 
 
 
308 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  41.69 
 
 
331 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  41.69 
 
 
319 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  40.6 
 
 
310 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  40.4 
 
 
319 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  39.33 
 
 
309 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  39.04 
 
 
354 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  39.04 
 
 
352 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  39.04 
 
 
307 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  39.04 
 
 
307 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3783  hypothetical protein  36.15 
 
 
311 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.68 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  26.09 
 
 
276 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.43 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.98 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.11 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.74 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.57 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.41 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.14 
 
 
273 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.28 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  28.5 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  24.68 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.53 
 
 
296 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.29 
 
 
260 aa  56.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.81 
 
 
257 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  27.45 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.29 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.22 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.1 
 
 
260 aa  52.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.52 
 
 
372 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  30.28 
 
 
300 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.6 
 
 
261 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.4 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.01 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.01 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.01 
 
 
303 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  26.29 
 
 
276 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  24.53 
 
 
289 aa  49.3  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.55 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  25.71 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  22.58 
 
 
332 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.71 
 
 
253 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  26.7 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  22.76 
 
 
268 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.15 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.73 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  22.41 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6245  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.63 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154868  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5094  hypothetical protein  30.48 
 
 
269 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.304515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>