65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4710 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  100 
 
 		 309 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  61.79 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  61.79 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  58.19 
 
 		 354 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  58.53 
 
 		 307 aa  381  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  58.19 
 
 		 352 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  58.19 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  56.03 
 
 		 310 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  54.49 
 
 		 332 aa  339  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  52.27 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  51.95 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  52.48 
 
 		 319 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3783  hypothetical protein  42.76 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  44.07 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  43.54 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  43.54 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  43.54 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  39.33 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.06 
 
 		 280 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.37 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.27 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.03 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.14 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.74 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  24.9 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.18 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.85 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.46 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.72 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  25.39 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.48 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.44 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  27.78 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.82 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.23 
 
 		 320 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.34 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.91 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  24.58 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  24.72 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.54 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.02 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.92 
 
 		 230 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.29 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  26.54 
 
 		 310 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0554  hypothetical protein  26.54 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.85 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  28.46 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.76 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  31.93 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.05 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.54 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.53 
 
 		 372 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.61 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  26.51 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.81 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  26.38 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.82 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.31 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.06 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.91 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  23.02 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.4 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>