37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3102 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
281 aa  588  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  25.93 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  25.59 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  25.25 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  23.26 
 
 
352 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  23.26 
 
 
354 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.15 
 
 
280 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  25.18 
 
 
309 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  24.28 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  23.15 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  25.34 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  23.39 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  25.34 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3783  hypothetical protein  24.83 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.75 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  22.82 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  22.82 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  22.82 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  22.64 
 
 
301 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.92 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  25.19 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.15 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  23.23 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.56 
 
 
302 aa  48.9  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.01 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.08 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  26.14 
 
 
311 aa  46.2  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  23.65 
 
 
304 aa  45.8  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  28.72 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  22.57 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  20.25 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.95 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  24.9 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.66 
 
 
300 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.57 
 
 
292 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.57 
 
 
292 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>