59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43511 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  100 
 
 
301 aa  627  1e-179  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.288196 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04647  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01850)  43.08 
 
 
313 aa  246  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  44.22 
 
 
299 aa  235  9e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35257  predicted protein  36.9 
 
 
296 aa  177  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109347  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  36.59 
 
 
276 aa  175  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  36.59 
 
 
276 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.68 
 
 
275 aa  169  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  30.54 
 
 
329 aa  132  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  30.51 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0554  hypothetical protein  30.8 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.88 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
257 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.86 
 
 
273 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  28.33 
 
 
289 aa  59.3  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.77 
 
 
230 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.43 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.43 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.17 
 
 
372 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.68 
 
 
261 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.18 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  27.45 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.42 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.81 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.47 
 
 
280 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.37 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.77 
 
 
293 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.83 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.54 
 
 
260 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  17.8 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  28.46 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.09 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.16 
 
 
253 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  28.08 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.91 
 
 
394 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  24.35 
 
 
307 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.03 
 
 
276 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.85 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.72 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  17.88 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.37 
 
 
394 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.03 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.72 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.03 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  23.48 
 
 
354 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  25.51 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  23.48 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  23.28 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.73 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  22.57 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  28.32 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.67 
 
 
259 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5094  hypothetical protein  23.45 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.304515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.17 
 
 
253 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  28.32 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.22 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.56 
 
 
278 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.7 
 
 
260 aa  42.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>