55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1581 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  100 
 
 
307 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  100 
 
 
352 aa  648    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  100 
 
 
354 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  97.07 
 
 
307 aa  631  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  83.55 
 
 
308 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  83.55 
 
 
308 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  57.19 
 
 
332 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  58.19 
 
 
309 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  56.39 
 
 
319 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  53.95 
 
 
310 aa  363  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  53.42 
 
 
331 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  53.42 
 
 
319 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3783  hypothetical protein  48.68 
 
 
311 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  45.7 
 
 
301 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  45.7 
 
 
301 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  45.7 
 
 
301 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  45.02 
 
 
301 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  39.04 
 
 
296 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  27.95 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.89 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.67 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.08 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.11 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.22 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.78 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.28 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.69 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.62 
 
 
260 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.26 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.39 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.94 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.2 
 
 
271 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.59 
 
 
273 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.86 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.29 
 
 
239 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.64 
 
 
296 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.74 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  30.77 
 
 
326 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.19 
 
 
270 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.79 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.68 
 
 
274 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  26.11 
 
 
300 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  27.81 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  23.28 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  24.71 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.46 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  25.86 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.96 
 
 
278 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.08 
 
 
253 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.74 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0554  hypothetical protein  21.83 
 
 
310 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  25.61 
 
 
314 aa  42.7  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.84 
 
 
261 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  22.67 
 
 
310 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.92 
 
 
300 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>