75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4330 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 292 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 292 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  71.92 
 
 		 292 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  58.87 
 
 		 295 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.56 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.78 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  29.5 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.08 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  35 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.11 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.08 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.97 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.06 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.89 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  29.78 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  30.92 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.36 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  37.67 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.15 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  24.73 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  26.48 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  23.51 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.16 
 
 		 265 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  31.3 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  25.19 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  27.41 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.9 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  30.49 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.09 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.14 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  22.59 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.56 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04607  conserved hypothetical protein  29.09 
 
 		 146 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0380015  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.372141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.14 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.35 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.37 
 
 		 251 aa  49.3  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  26.61 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  26.61 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.61 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.61 
 
 		 306 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  24.19 
 
 		 281 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.93 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.94 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  36.36 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  23.2 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.7 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.7 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.85 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.7 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.83 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.52 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41990  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.14 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.08 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.52 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.55 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  26.14 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  27.52 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.52 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.58 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.58 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  26.27 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  21.74 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.85 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.41 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.94 
 
 		 277 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.61 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.41 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.23 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.61 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  28.97 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.97 
 
 		 239 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.57 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>