60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0445 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 282 aa  587  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  51.52 
 
 		 315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.57 
 
 		 269 aa  268  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  36.82 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.98 
 
 		 285 aa  148  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.32 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.85 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  31.88 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.29 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.88 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.03 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.15 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.15 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.4 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  30.24 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.99 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  30.32 
 
 		 320 aa  89.4  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  30.06 
 
 		 270 aa  89  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  32.09 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  28.64 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.71 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.19 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.96 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  30.05 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  27.71 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.74 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  32.02 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  25.89 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  23.02 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386049 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  26.64 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  27 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.6 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  28.37 
 
 		 416 aa  58.9  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.19 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.06 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1020  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.03 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  23.83 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00020  expressed protein  21.72 
 
 		 327 aa  52.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.326612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2233  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.35 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2171  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.35 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.61 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.11 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0615  hypothetical protein  26.17 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.25162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  24.53 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48742  predicted protein  25.68 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526159  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87319  predicted protein  26 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.132379  decreased coverage  0.000311139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.12 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.77 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.22 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0974  hypothetical protein  29.13 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.76 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  29.91 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.4 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.67 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.58 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.49 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>