66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0569 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  590  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  34.33 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.12 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.37 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  23.51 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3772  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561015  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  26.4 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.54 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.05 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  33.07 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.73 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3967  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4033  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.81 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3484  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.53 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.660208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26210  Phytanoyl-CoA dioxygenase protein  26.47 
 
 		 398 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.22 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03000  conserved hypothetical protein  25.29 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2406  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.46 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.14 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  25.39 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.65 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03160  conserved hypothetical protein  23.67 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661561  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2614  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.42 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.19 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.73 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  25.77 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.59 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1851  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.62 
 
 		 391 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.59 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.73 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.83 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.73 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1813  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.12 
 
 		 393 aa  53.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.864664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.18 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.05 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.18 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06051  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09620)  23.47 
 
 		 410 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1278  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.14 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0445475  normal  0.279697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.91 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  25.19 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2769  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.35 
 
 		 395 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.83 
 
 		 398 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3592  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.58 
 
 		 399 aa  49.3  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.48 
 
 		 257 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4205  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.5 
 
 		 404 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.351992 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.33 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.01 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.89 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3882  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.35 
 
 		 316 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3531  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.97 
 
 		 393 aa  46.2  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0319  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.74 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.7 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.68 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.68 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.326612 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.6 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  22.75 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  22.75 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  22.75 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  22.75 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.23 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  22.75 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  24.88 
 
 		 416 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  22.26 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>