25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2885 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
398 aa  818    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4205  Phytanoyl-CoA dioxygenase  63.9 
 
 
404 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.351992 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3531  phytanoyl-CoA dioxygenase  55.64 
 
 
393 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4033  Phytanoyl-CoA dioxygenase  55.27 
 
 
396 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3772  Phytanoyl-CoA dioxygenase  50.13 
 
 
395 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561015  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1428  phytanoyl-CoA dioxygenase  56.52 
 
 
382 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1278  phytanoyl-CoA dioxygenase  55.29 
 
 
389 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0445475  normal  0.279697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3484  Phytanoyl-CoA dioxygenase  50.13 
 
 
395 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.660208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2406  Phytanoyl-CoA dioxygenase  51.74 
 
 
398 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1851  phytanoyl-CoA dioxygenase  54.86 
 
 
391 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2769  Phytanoyl-CoA dioxygenase  51.42 
 
 
395 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26210  Phytanoyl-CoA dioxygenase protein  51.47 
 
 
398 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1813  phytanoyl-CoA dioxygenase  51.84 
 
 
393 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.864664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3592  Phytanoyl-CoA dioxygenase  47.21 
 
 
399 aa  346  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2614  phytanoyl-CoA dioxygenase  51.52 
 
 
387 aa  345  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3967  phytanoyl-CoA dioxygenase  50 
 
 
400 aa  341  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06051  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09620)  44.62 
 
 
410 aa  325  8.000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03160  conserved hypothetical protein  42.59 
 
 
433 aa  311  2e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661561  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03000  conserved hypothetical protein  40.69 
 
 
394 aa  299  5e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472148  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.09 
 
 
288 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  27.83 
 
 
284 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  28.49 
 
 
289 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  27.22 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.51 
 
 
302 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.9 
 
 
291 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>