22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4033 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4033  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 396 aa  788    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2769  Phytanoyl-CoA dioxygenase  61.93 
 
 		 395 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1813  phytanoyl-CoA dioxygenase  60.26 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.864664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3592  Phytanoyl-CoA dioxygenase  56.11 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4205  Phytanoyl-CoA dioxygenase  57.22 
 
 		 404 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.351992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3772  Phytanoyl-CoA dioxygenase  54.62 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561015  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3484  Phytanoyl-CoA dioxygenase  55.77 
 
 		 395 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.660208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2406  Phytanoyl-CoA dioxygenase  53.96 
 
 		 398 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  55.27 
 
 		 398 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3967  phytanoyl-CoA dioxygenase  56.23 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2614  phytanoyl-CoA dioxygenase  53.96 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1851  phytanoyl-CoA dioxygenase  56.17 
 
 		 391 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3531  phytanoyl-CoA dioxygenase  52.66 
 
 		 393 aa  398  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1278  phytanoyl-CoA dioxygenase  52.49 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0445475  normal  0.279697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1428  phytanoyl-CoA dioxygenase  54.01 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26210  Phytanoyl-CoA dioxygenase protein  54.7 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03000  conserved hypothetical protein  47.76 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472148  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03160  conserved hypothetical protein  45.24 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661561  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06051  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09620)  45.74 
 
 		 410 aa  333  3e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  27.81 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.26 
 
 		 288 aa  47  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.4 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>