23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1278 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1278  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 389 aa  782    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0445475  normal  0.279697 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3531  phytanoyl-CoA dioxygenase  58.01 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1428  phytanoyl-CoA dioxygenase  61.6 
 
 		 382 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4205  Phytanoyl-CoA dioxygenase  57.33 
 
 		 404 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.351992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  55.29 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2769  Phytanoyl-CoA dioxygenase  53.45 
 
 		 395 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3772  Phytanoyl-CoA dioxygenase  52.23 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561015  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2406  Phytanoyl-CoA dioxygenase  52.93 
 
 		 398 aa  388  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3967  phytanoyl-CoA dioxygenase  52.93 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1851  phytanoyl-CoA dioxygenase  55.61 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3592  Phytanoyl-CoA dioxygenase  51.72 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3484  Phytanoyl-CoA dioxygenase  51.64 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.660208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4033  Phytanoyl-CoA dioxygenase  52.49 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1813  phytanoyl-CoA dioxygenase  50.26 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.864664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2614  phytanoyl-CoA dioxygenase  50.4 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26210  Phytanoyl-CoA dioxygenase protein  48.28 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03160  conserved hypothetical protein  43.39 
 
 		 433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661561  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06051  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09620)  41.65 
 
 		 410 aa  300  4e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03000  conserved hypothetical protein  41.53 
 
 		 394 aa  295  9e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472148  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  26.14 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.34 
 
 		 288 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.43 
 
 		 267 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>