20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3592 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3592  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 399 aa  818    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4033  Phytanoyl-CoA dioxygenase  56.11 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2769  Phytanoyl-CoA dioxygenase  58.95 
 
 		 395 aa  441  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1813  phytanoyl-CoA dioxygenase  56.69 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.864664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3484  Phytanoyl-CoA dioxygenase  53.12 
 
 		 395 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.660208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3772  Phytanoyl-CoA dioxygenase  52.25 
 
 		 395 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561015  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3967  phytanoyl-CoA dioxygenase  54.42 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2614  phytanoyl-CoA dioxygenase  54.13 
 
 		 387 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2406  Phytanoyl-CoA dioxygenase  51.84 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4205  Phytanoyl-CoA dioxygenase  50.51 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.351992 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1278  phytanoyl-CoA dioxygenase  51.72 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0445475  normal  0.279697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26210  Phytanoyl-CoA dioxygenase protein  47.75 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1851  phytanoyl-CoA dioxygenase  51.44 
 
 		 391 aa  357  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3531  phytanoyl-CoA dioxygenase  48.8 
 
 		 393 aa  355  6.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.21 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1428  phytanoyl-CoA dioxygenase  46.75 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.809947 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06051  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09620)  44.42 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03000  conserved hypothetical protein  42.82 
 
 		 394 aa  296  5e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472148  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03160  conserved hypothetical protein  40.31 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661561  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  26.58 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>