26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3967 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3967  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
400 aa  815    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2614  phytanoyl-CoA dioxygenase  77.58 
 
 
387 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2769  Phytanoyl-CoA dioxygenase  61.03 
 
 
395 aa  474  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3772  Phytanoyl-CoA dioxygenase  54.45 
 
 
395 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561015  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1813  phytanoyl-CoA dioxygenase  56.32 
 
 
393 aa  418  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.864664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4033  Phytanoyl-CoA dioxygenase  56.23 
 
 
396 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3484  Phytanoyl-CoA dioxygenase  52.86 
 
 
395 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.660208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3592  Phytanoyl-CoA dioxygenase  54.42 
 
 
399 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2406  Phytanoyl-CoA dioxygenase  52.76 
 
 
398 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1278  phytanoyl-CoA dioxygenase  52.93 
 
 
389 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0445475  normal  0.279697 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4205  Phytanoyl-CoA dioxygenase  50.92 
 
 
404 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.351992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1428  phytanoyl-CoA dioxygenase  51.21 
 
 
382 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3531  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.18 
 
 
393 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1851  phytanoyl-CoA dioxygenase  52.27 
 
 
391 aa  346  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  50 
 
 
398 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26210  Phytanoyl-CoA dioxygenase protein  48.39 
 
 
398 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03000  conserved hypothetical protein  44.41 
 
 
394 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472148  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03160  conserved hypothetical protein  43.7 
 
 
433 aa  308  8e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661561  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06051  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09620)  42.12 
 
 
410 aa  286  5e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  27.27 
 
 
284 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.58 
 
 
274 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 
320 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.85 
 
 
267 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  28.03 
 
 
289 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.24 
 
 
288 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.6 
 
 
291 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>