24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG03000 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG03000  conserved hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  826    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472148  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03160  conserved hypothetical protein  72.34 
 
 
433 aa  633  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4033  Phytanoyl-CoA dioxygenase  47.76 
 
 
396 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26210  Phytanoyl-CoA dioxygenase protein  47.76 
 
 
398 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06051  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09620)  46.21 
 
 
410 aa  348  8e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3531  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.95 
 
 
393 aa  325  7e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2406  Phytanoyl-CoA dioxygenase  44.01 
 
 
398 aa  324  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1813  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.58 
 
 
393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.864664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3772  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.59 
 
 
395 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561015  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2769  Phytanoyl-CoA dioxygenase  43.44 
 
 
395 aa  313  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3967  phytanoyl-CoA dioxygenase  44.41 
 
 
400 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3484  Phytanoyl-CoA dioxygenase  43.21 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.660208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2614  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.44 
 
 
387 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1428  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.29 
 
 
382 aa  305  9.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4205  Phytanoyl-CoA dioxygenase  43.06 
 
 
404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.351992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1851  phytanoyl-CoA dioxygenase  41.76 
 
 
391 aa  300  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  40.69 
 
 
398 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3592  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.82 
 
 
399 aa  296  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1278  phytanoyl-CoA dioxygenase  41.53 
 
 
389 aa  295  9e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0445475  normal  0.279697 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  25.29 
 
 
284 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  25.57 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 
320 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.5 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.81 
 
 
288 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>