48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2814 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  65.6 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  54.21 
 
 		 288 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  33.45 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  36.03 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  35.07 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.7 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.31 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.92 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.92 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.6 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.14 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  28.35 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.69 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.77 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.53 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.35 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.05 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.65 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.56 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  27.1 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.63 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  29.29 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  27.82 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  33.57 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  30.99 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.53 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.55 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09254  conserved hypothetical protein  39.76 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0342927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.47 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.87 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03160  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 433 aa  50.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.49 
 
 		 398 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03000  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 		 394 aa  48.9  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  30.47 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3967  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.03 
 
 		 400 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.93 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04607  conserved hypothetical protein  31.03 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0380015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2614  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.5 
 
 		 387 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3484  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.37 
 
 		 395 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.660208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.13 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.43 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.48 
 
 		 230 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  22.26 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3531  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.1 
 
 		 393 aa  42.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2406  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.01 
 
 		 398 aa  42.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>