54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2677 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 269 aa  561  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  54.09 
 
 		 315 aa  298  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  47.57 
 
 		 282 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  40.37 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.24 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  31.2 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.46 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.46 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.07 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.71 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.35 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  34.73 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.03 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.64 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.59 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.72 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.6 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  28.93 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.82 
 
 		 291 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  28.11 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  26.45 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.61 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  24.8 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  23.38 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.19 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  29.25 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.34 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  22.92 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  26.56 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  26.64 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00020  expressed protein  27.27 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386049 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  21.69 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2233  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.6 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2171  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.6 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  22.51 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.04 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.326612 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1020  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.71 
 
 		 296 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.86 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  33.64 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.04 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  31.11 
 
 		 566 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.03 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.9 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.11 
 
 		 398 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00615  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03330)  23 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41583  predicted protein  31.58 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.531916  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37164  predicted protein  25.15 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.4 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.31 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.93 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48742  predicted protein  23.17 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>