72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0212 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 315 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  51.52 
 
 		 282 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  54.09 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  36.6 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.54 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  34.04 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.33 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.96 
 
 		 265 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.11 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.11 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.36 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.22 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.93 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.34 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  29.27 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.64 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.93 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  27.6 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  28.77 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.83 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  27.67 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  27.57 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.75 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  26.75 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.14 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.07 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  26.36 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  26.42 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  24.14 
 
 		 416 aa  62.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.32 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.68 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  24.19 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2233  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.2 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2171  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.2 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.58 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.45 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.03 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.02 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1020  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.36 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00020  expressed protein  22.5 
 
 		 327 aa  49.3  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  34.07 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.3 
 
 		 248 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.29 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  34.04 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  25.62 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.07 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  34.07 
 
 		 253 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.72 
 
 		 277 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  34.07 
 
 		 306 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  34.07 
 
 		 297 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  34.07 
 
 		 253 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  34.07 
 
 		 256 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.09 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.66 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.03 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.326612 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.41 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.87 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  21.78 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.97 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.87 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.14 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.87 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26210  Phytanoyl-CoA dioxygenase protein  29.2 
 
 		 398 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.24 
 
 		 276 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.05 
 
 		 272 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.07 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.42 
 
 		 253 aa  42.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>