59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1239 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 295 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41990  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.02 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.58 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.79 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.91 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.51 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3795  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.89 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.55 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.05 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.28 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  36.14 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  36.14 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.23 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.23 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  26.67 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.03 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.61 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.46 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.97 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1922  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.48 
 
 		 390 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.47 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.67 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.69 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  26.12 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.39 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.1 
 
 		 275 aa  45.8  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.71 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.14 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.66 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.2 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  26.24 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  28.24 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  26.24 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  28 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.14 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.24 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  26.24 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  26.24 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.93 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.35 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3596  hypothetical protein  32 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  25.81 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0319  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.39 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.533588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.87 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.4 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.54 
 
 		 394 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6528  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.26 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.35 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.61 
 
 		 259 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.54 
 
 		 394 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.6 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.27 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.27 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.05 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  24.11 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>