27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3596 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3596  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0573  Phytanoyl-CoA dioxygenase  63.45 
 
 		 237 aa  320  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0114  hypothetical protein  34.23 
 
 		 221 aa  148  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.715371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0983  hypothetical protein  35.76 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0447531  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3189  hypothetical protein  31.84 
 
 		 226 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3369  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.56 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1059  hypothetical protein  23.88 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.516265  normal  0.195926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.37 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.52 
 
 		 280 aa  52  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.54 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.7 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.33 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.47 
 
 		 300 aa  45.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.67 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.34 
 
 		 320 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.8 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.38 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  25.6 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  19.49 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  19.47 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  32 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.71 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3795  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.34 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4809  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.37 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00887466  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.73 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  33.75 
 
 		 289 aa  42  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>