15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0114 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0114  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  460  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.715371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0573  Phytanoyl-CoA dioxygenase  39.13 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3596  hypothetical protein  34.23 
 
 		 238 aa  148  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3369  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.11 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3189  hypothetical protein  36.69 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0983  hypothetical protein  36.94 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0447531  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1059  hypothetical protein  30.16 
 
 		 152 aa  85.5  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.516265  normal  0.195926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  41.1 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2447  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.32 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.12 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.51 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.71 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.3 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.53 
 
 		 293 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  24.38 
 
 		 298 aa  41.6  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>