49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6796 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
291 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  65.6 
 
 
289 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.15 
 
 
288 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  32.75 
 
 
298 aa  149  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  32.96 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  32.36 
 
 
416 aa  126  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.45 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.36 
 
 
292 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.36 
 
 
292 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.1 
 
 
292 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.96 
 
 
302 aa  99.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 
320 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.22 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.83 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.86 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.35 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.74 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.49 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  28 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  25.48 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  25.28 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  29.63 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.06 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  30.77 
 
 
304 aa  62.4  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  24.22 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.14 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  30.71 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.96448 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  23.42 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386049 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09254  conserved hypothetical protein  38.24 
 
 
148 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0342927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.37 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.33 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.41 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1020  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.36 
 
 
296 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04607  conserved hypothetical protein  42.47 
 
 
146 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0380015  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  29.23 
 
 
252 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.67 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.08 
 
 
230 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.59 
 
 
273 aa  45.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.75 
 
 
278 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1428  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.39 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  22.71 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03000  conserved hypothetical protein  23.5 
 
 
394 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472148  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03160  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 
433 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661561  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  24.49 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3967  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.6 
 
 
400 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.47 
 
 
259 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.9 
 
 
398 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2233  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.29 
 
 
314 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2171  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.29 
 
 
314 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>