40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5728 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 287 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.88 
 
 		 302 aa  175  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.21 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  34.3 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.94 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.95 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.78 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.78 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.2 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.45 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.85 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  33.7 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.95 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.45 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.22 
 
 		 315 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.89 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  29.32 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  32.65 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  27.31 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  28.29 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.67 
 
 		 265 aa  92.4  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  25 
 
 		 416 aa  82.4  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  28.17 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  25.6 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  23.62 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  25.09 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.37 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  23.11 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2171  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.28 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2233  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.28 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  22.59 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.51 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.78 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.4 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  25.39 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  24.23 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.87 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.69 
 
 		 277 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.08 
 
 		 248 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>