41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7153 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.03 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  29.33 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  28.83 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 269 aa  95.9  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.24 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.6 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  26.88 
 
 		 270 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.17 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  33.96 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.87 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.23 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.82 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  27.82 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.77 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  28.36 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  27 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.11 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  27.49 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.35 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.49 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.49 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.77 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.5 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  29.67 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  25.19 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  23.94 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  28.57 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.79 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.97 
 
 		 230 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.05 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  23.86 
 
 		 252 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  28.85 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.25 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5697  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1647  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  21.03 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  25.71 
 
 		 281 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  26.76 
 
 		 416 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.22 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>