14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5697 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5697  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 305 aa  616  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3795  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.2 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3132  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.59 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3328  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.55 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3622  hypothetical protein  25.43 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4809  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.89 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00887466  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.12 
 
 		 270 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.14 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2447  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.99 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  25.73 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.48 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  23.08 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  29.58 
 
 		 281 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>